Конечно же, первым делом стоит проработать договор совместно с командой юристов. Включите в договор привязку ко времени. Заказчик должен в течение двух недель подписать акт или прислать мотивированный отказ.
После этого срока акт будет считаться подписанным. Продумайте, от какой даты считать срок для подписания: передача файлов, размещение сайта на хостинге или другое событие.
Ставьте заказчика в известность письменно в том виде, в каком указано в договоре: по электронной почте, через обычную почту или отправьте акты курьером.